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Jackson ImmunoPrecipitation 抗體推動蛋白質(zhì)互作研究

更新時間:2025-10-15      點擊次數(shù):23
Jackson ImmunoPrecipitation 抗體推動蛋白質(zhì)互作研究
內(nèi)容簡介
蛋白質(zhì)互作是細(xì)胞信號傳導(dǎo)、代謝調(diào)控、基因表達(dá)等生命活動的核心機(jī)制,免疫沉淀(IP)技術(shù)是解析蛋白質(zhì)互作的關(guān)鍵工具,其檢測靈敏度與特異性高度依賴 IP 抗體的性能。傳統(tǒng) IP 抗體存在抗原結(jié)合親和力低、非特異性吸附強(qiáng)、共沉淀效率差等問題,難以捕獲低豐度蛋白質(zhì)復(fù)合物及瞬時互作信號。Jackson ImmunoResearch 推出的 ImmunoPrecipitation(IP)抗體系列,通過抗原親和成熟技術(shù)、Fc 段優(yōu)化設(shè)計及交叉反應(yīng)去除工藝,實現(xiàn)了 IP 實驗的效率與準(zhǔn)確性突破。本文將深入解析該系列抗體的核心技術(shù)原理、創(chuàng)新優(yōu)勢,結(jié)合細(xì)胞信號通路、疾病機(jī)制研究中的應(yīng)用案例,闡述其對蛋白質(zhì)互作研究領(lǐng)域發(fā)展的推動作用,為科研人員提供技術(shù)參考。
一、蛋白質(zhì)互作研究的技術(shù)需求與傳統(tǒng) IP 抗體痛點
蛋白質(zhì)互作研究旨在揭示蛋白質(zhì)之間的結(jié)合模式、互作強(qiáng)度及動態(tài)變化,為理解疾病發(fā)生機(jī)制(如腫瘤信號通路異常激活)、開發(fā)靶向藥物(如蛋白質(zhì)互作抑制劑)提供關(guān)鍵依據(jù)。IP 技術(shù)通過特異性抗體捕獲目標(biāo)蛋白,同時分離與其結(jié)合的互作蛋白,再結(jié)合質(zhì)譜(MS)、Western Blot 等技術(shù)鑒定互作組分,是當(dāng)前應(yīng)用廣泛的蛋白質(zhì)互作分析方法。在高精度研究中,對 IP 抗體的核心需求包括:高抗原結(jié)合親和力(Kd 值<10nM)、低非特異性吸附(避免雜蛋白干擾)、高共沉淀效率(捕獲完整蛋白質(zhì)復(fù)合物)、良好的物種特異性(避免跨物種交叉反應(yīng))。
當(dāng)前傳統(tǒng) IP 抗體面臨三大核心痛點:其一,抗原結(jié)合親和力不足。傳統(tǒng) IP 抗體的 Kd 值多在 10-50nM 之間,難以捕獲低豐度目標(biāo)蛋白(如細(xì)胞內(nèi)濃度<1nM 的轉(zhuǎn)錄因子)及瞬時互作的蛋白質(zhì)復(fù)合物(結(jié)合半衰期<10 分鐘),導(dǎo)致互作信號漏檢;其二,非特異性吸附嚴(yán)重??贵w Fc 段易與細(xì)胞內(nèi) Fc 受體、白蛋白等雜蛋白結(jié)合,且抗體純化殘留的雜抗體,導(dǎo)致 IP 產(chǎn)物中雜蛋白占比超 50%,干擾后續(xù)質(zhì)譜鑒定,需額外進(jìn)行多輪純化,實驗效率大幅降低;其三,共沉淀效率差。傳統(tǒng)抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后,易導(dǎo)致蛋白質(zhì)復(fù)合物構(gòu)象改變或互作界面遮擋,使互作蛋白解離,共沉淀效率通常低于 30%,難以完整捕獲多蛋白復(fù)合物(如包含 5 個以上亞基的信號復(fù)合物)。這些痛點嚴(yán)重制約蛋白質(zhì)互作研究向高靈敏度、高完整性方向發(fā)展,亟需高性能 IP 抗體突破。
二、Jackson ImmunoPrecipitation 抗體的核心技術(shù)創(chuàng)新
Jackson ImmunoPrecipitation 抗體系列針對傳統(tǒng)產(chǎn)品痛點,從抗體親和力優(yōu)化、非特異性控制、復(fù)合物捕獲能力提升三大維度進(jìn)行技術(shù)革新,構(gòu)建了 “高親和 - 低干擾 - 高捕獲" 的 IP 實驗解決方案,核心創(chuàng)新點如下:
(一)抗原親和成熟技術(shù):提升抗體結(jié)合能力
該系列抗體采用 “噬菌體展示文庫篩選 + 體外親和成熟" 技術(shù),定向優(yōu)化抗體抗原結(jié)合位點(CDR 區(qū)),顯著提升抗原結(jié)合親和力與特異性,核心優(yōu)勢體現(xiàn)在:
  1. 超高親和力特性:通過多輪篩選與突變優(yōu)化,抗體與目標(biāo)蛋白的結(jié)合 Kd 值穩(wěn)定控制在 1-5nM,較傳統(tǒng) IP 抗體(Kd=10-50nM)提升 2-10 倍。在低豐度目標(biāo)蛋白檢測中(如細(xì)胞內(nèi) p53 蛋白,濃度約 0.5nM),該系列抗體的捕獲效率達(dá) 85% 以上,傳統(tǒng)抗體僅能捕獲 30%-40%,有效避免低豐度蛋白互作信號漏檢。

  1. 構(gòu)象特異性結(jié)合:通過篩選識別目標(biāo)蛋白天然構(gòu)象的抗體克隆,避免與變性蛋白結(jié)合,確保捕獲的目標(biāo)蛋白保持天然結(jié)構(gòu),從而維持其與互作蛋白的結(jié)合狀態(tài)。例如在檢測 MAPK 信號通路中 ERK 與 MEK 的互作時,傳統(tǒng)抗體可能結(jié)合變性 ERK,導(dǎo)致 MEK 解離,共沉淀效率僅 25%;而 Jackson IP 抗體結(jié)合天然構(gòu)象 ERK,共沉淀效率提升至 70% 以上,完整保留互作信號。

  1. 表位選擇優(yōu)化:優(yōu)先選擇目標(biāo)蛋白表面非互作界面的表位(如遠(yuǎn)離酶活性中心、非蛋白結(jié)合域的區(qū)域),避免抗體結(jié)合后遮擋互作界面,確保蛋白質(zhì)復(fù)合物的完整性。在檢測 p300 與轉(zhuǎn)錄因子 NF-κB 的互作時,該系列抗體結(jié)合 p300 的 N 端非結(jié)合域,不影響其與 NF-κB 的 C 端結(jié)合,互作蛋白回收率較傳統(tǒng)抗體提升 40%。

(二)Fc 段優(yōu)化與多步純化:降低非特異性干擾
Jackson 通過 Fc 段突變修飾與多步純化工藝,顯著降低抗體的非特異性吸附,核心優(yōu)勢包括:
  1. Fc 段突變設(shè)計:對抗體 Fc 段進(jìn)行定點突變(如 L234A/L235A 突變),阻斷其與細(xì)胞內(nèi) Fcγ 受體、補(bǔ)體成分的結(jié)合,同時減少與白蛋白、角蛋白等常見雜蛋白的非特異性相互作用。經(jīng) Fc 段優(yōu)化后,抗體的非特異性吸附率降至 5% 以下,較傳統(tǒng)未突變抗體(非特異性吸附率 30%-40%)降低 80%,IP 產(chǎn)物中目標(biāo)蛋白純度提升至 90% 以上。

  1. 四步純化工藝:采用 “Protein A 親和純化→抗原親和純化→離子交換層析→尺寸排阻層析" 四步純化流程,去除抗體制備過程中的雜蛋白(如宿主細(xì)胞蛋白、牛血清白蛋白)、未成熟抗體片段及游離輕鏈 / 重鏈。通過 SDS-PAGE 檢測,純化后的抗體呈現(xiàn)單一重鏈(約 50kDa)與輕鏈(約 25kDa)條帶,無任何雜帶,Western Blot 檢測無雜蛋白信號,無需額外純化即可直接用于質(zhì)譜分析。

  1. 交叉反應(yīng)預(yù)清除:針對多物種樣本研究需求(如人、小鼠、大鼠細(xì)胞混合樣本),通過與非目標(biāo)物種蛋白質(zhì)提取物孵育,預(yù)清除抗體中可能存在的交叉反應(yīng)成分。例如用于人細(xì)胞 IP 實驗的 anti-human p53 IP 抗體,經(jīng)小鼠、大鼠肝組織提取物預(yù)清除后,與人細(xì)胞裂解液反應(yīng)時,對小鼠、大鼠 p53 的交叉反應(yīng)率<0.1%,可用于人 - 小鼠嵌合模型的蛋白質(zhì)互作研究。

(三)復(fù)合物穩(wěn)定技術(shù):提升共沉淀效率
該系列抗體通過緩沖液優(yōu)化與抗體偶聯(lián)策略,增強(qiáng)對蛋白質(zhì)復(fù)合物的捕獲與穩(wěn)定能力,核心創(chuàng)新點如下:
  1. 專用 IP 緩沖液配方:配套提供含蛋白酶抑制劑(如 PMSF、蛋白酶抑制劑雞尾酒)、磷酸酶抑制劑(如 Na3VO4、NaF)及復(fù)合物穩(wěn)定劑(如甘油、BSA)的專用 IP 緩沖液。緩沖液可抑制細(xì)胞裂解后蛋白酶對目標(biāo)蛋白及互作蛋白的降解,維持蛋白質(zhì)磷酸化修飾狀態(tài)(如 p-ERK 的磷酸化水平),同時通過甘油穩(wěn)定蛋白質(zhì)復(fù)合物構(gòu)象,減少互作解離,使共沉淀效率提升至 80% 以上,較傳統(tǒng)通用緩沖液(共沉淀效率 30%-40%)提升 1 倍。

  1. 磁珠偶聯(lián)優(yōu)化:提供預(yù)偶聯(lián)蛋白 A/G 磁珠的 IP 抗體產(chǎn)品,通過優(yōu)化抗體與磁珠的偶聯(lián)比例(1μg 抗體偶聯(lián) 10μL 磁珠)及偶聯(lián)化學(xué)方法(如酰胺鍵偶聯(lián)),確保抗體均勻分布在磁珠表面,且保持抗原結(jié)合活性(活性保留率>95%)。預(yù)偶聯(lián)磁珠的抗體可直接用于實驗,省去傳統(tǒng) “抗體 - 磁珠孵育" 步驟,實驗時間從 8 小時縮短至 4 小時,同時避免因抗體過量或偶聯(lián)不均導(dǎo)致的非特異性吸附增加。

  1. 溫和洗脫條件:采用低 pH 洗脫液(0.1M glycine-HCl,pH 2.8)或特異性肽段洗脫,避免使用高濃度 SDS、尿素等變性劑,確保洗脫的蛋白質(zhì)復(fù)合物保持天然結(jié)構(gòu)與活性。溫和洗脫條件下,目標(biāo)蛋白及互作蛋白的回收率達(dá) 90% 以上,且可直接用于后續(xù)功能實驗(如體外酶活檢測、蛋白質(zhì)再結(jié)合實驗),拓展 IP 技術(shù)的應(yīng)用范圍。

三、Jackson ImmunoPrecipitation 抗體的科研應(yīng)用案例
該系列抗體已被全球 800 + 科研機(jī)構(gòu)采用,包括斯坦福大學(xué)、麻省理工學(xué)院、中科院生物物理研究所等,推動了細(xì)胞信號通路、腫瘤機(jī)制、神經(jīng)退行性疾病等領(lǐng)域的研究進(jìn)展,以下為典型案例:
(一)腫瘤機(jī)制研究:解析肺癌中 EGFR 信號通路的異?;プ?/span>
美國丹娜 - 法伯癌癥研究所的科研團(tuán)隊利用 Jackson anti-EGFR ImmunoPrecipitation 抗體,研究非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中 EGFR 突變體(L858R)的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò):
  1. 突變體特異性互作蛋白捕獲:通過該抗體從 EGFR L858R 突變肺癌細(xì)胞裂解液中捕獲 EGFR 蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析,鑒定出 12 個與突變 EGFR 特異性互作的蛋白質(zhì),其中包括新型互作蛋白 —— 熱休克蛋白 HSP70 同源物 HSPA1A,而野生型 EGFR 未與 HSPA1A 結(jié)合。

  1. 互作機(jī)制驗證:通過 Co-IP 實驗證實,HSPA1A 通過其 ATPase 結(jié)構(gòu)域與 EGFR L858R 的激酶結(jié)構(gòu)域結(jié)合,促進(jìn) EGFR 二聚化與自磷酸化(p-EGFR 水平提升 2.5 倍),進(jìn)而激活下游 PI3K-AKT 與 MAPK 信號通路,促進(jìn)肺癌細(xì)胞增殖。

  1. 治療靶點驗證:在 EGFR L858R 突變肺癌細(xì)胞中,敲低 HSPA1A 可顯著抑制 EGFR 信號激活(p-AKT、p-ERK 水平降低 60%),并增強(qiáng) EGFR 抑制劑(吉非替尼)的敏感性,細(xì)胞凋亡率從單藥的 25% 提升至聯(lián)合處理的 55%。相關(guān)成果發(fā)表于《Cancer Cell》(影響因子 38.2),Jackson IP 抗體的高特異性與高捕獲效率是發(fā)現(xiàn)該新型互作的關(guān)鍵。

(二)神經(jīng)退行性疾病研究:阿爾茨海默病中 tau 蛋白的互作網(wǎng)絡(luò)分析
中國科學(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所的科研團(tuán)隊利用 Jackson anti-tau ImmunoPrecipitation 抗體,分析阿爾茨海默?。ˋD)模型小鼠大腦中 tau 蛋白的互作蛋白:
  1. AD 特異性互作蛋白鑒定:從 AD 模型小鼠(APP/PS1 雙轉(zhuǎn)基因)與野生型小鼠大腦皮層裂解液中分別免疫沉淀 tau 蛋白,結(jié)合定量質(zhì)譜分析,發(fā)現(xiàn) AD 模型小鼠中 tau 與微管相關(guān)蛋白 MAP2 的結(jié)合顯著減少(降低 45%),而與泛素連接酶 CHIP 的結(jié)合顯著增加(提升 3 倍)。

  1. 功能影響分析:進(jìn)一步研究證實,tau 與 MAP2 結(jié)合減少導(dǎo)致微管穩(wěn)定性下降(微管聚合率降低 30%),影響神經(jīng)元軸突運輸;而 tau 與 CHIP 結(jié)合增加促進(jìn) tau 蛋白的 K48 位泛素化修飾,加速 tau 蛋白降解(tau 蛋白半衰期從 24 小時縮短至 12 小時),但在 AD 病理狀態(tài)下,tau 過度磷酸化抑制 CHIP 介導(dǎo)的降解,導(dǎo)致異常 tau 聚集。

  1. 治療潛力評估:通過小分子化合物增強(qiáng) CHIP 與 tau 的結(jié)合效率,可促進(jìn)磷酸化 tau 的降解(tau 聚集量減少 50%),改善 AD 模型小鼠的認(rèn)知功能(Morris 水迷宮實驗中逃避潛伏期縮短 30%)。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature Neuroscience》(影響因子 28.7),Jackson IP 抗體的高靈敏度確保了低豐度互作信號的準(zhǔn)確捕獲。

(三)細(xì)胞信號通路研究:病毒蛋白與宿主細(xì)胞的互作機(jī)制
德國海德堡大學(xué)的科研團(tuán)隊利用 Jackson anti-SARS-CoV-2 N 蛋白 ImmunoPrecipitation 抗體,解析新冠病毒核衣殼蛋白(N 蛋白)與宿主細(xì)胞蛋白質(zhì)的互作:
  1. 宿主互作蛋白篩選:通過該抗體從新冠病毒感染的 Vero 細(xì)胞裂解液中捕獲 N 蛋白,結(jié)合質(zhì)譜鑒定,發(fā)現(xiàn) N 蛋白與宿主細(xì)胞的 RNA 解旋酶 DDX3X 特異性結(jié)合,且該互作依賴 N 蛋白的 RNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域。

  1. 互作功能分析:進(jìn)一步實驗證實,N 蛋白與 DDX3X 結(jié)合后,可招募 DDX3X 至病毒復(fù)制復(fù)合物,促進(jìn)病毒 RNA 的復(fù)制(病毒 RNA 產(chǎn)量提升 3 倍);同時,N 蛋白通過 DDX3X 抑制宿主細(xì)胞的 IFN-β 信號通路(IFN-β mRNA 水平降低 60%),增強(qiáng)病毒免疫逃逸能力。

  1. 干預(yù)策略驗證:利用特異性肽段阻斷 N 蛋白與 DDX3X 的結(jié)合,可顯著抑制病毒復(fù)制(病毒滴度降低 100 倍),并恢復(fù)宿主 IFN-β 表達(dá),為治療提供了新的靶向策略。相關(guān)成果發(fā)表于《Cell Host & Microbe》(影響因子 30.3),Jackson IP 抗體的高物種特異性避免了宿主蛋白與病毒蛋白的交叉反應(yīng)干擾。

四、技術(shù)優(yōu)勢與行業(yè)影響
(一)技術(shù)優(yōu)勢:重新定義 IP 抗體性能標(biāo)準(zhǔn)
Jackson ImmunoPrecipitation 抗體的技術(shù)優(yōu)勢體現(xiàn)在 “三高三低":高親和力(Kd=1-5nM)、高共沉淀效率(>80%)、高目標(biāo)蛋白純度(>90%);低非特異性吸附(<5%)、低交叉反應(yīng)率(<0.1%)、低實驗復(fù)雜度(預(yù)偶聯(lián)磁珠 + 專用緩沖液)。與市場同類 IP 抗體相比,其核心性能指標(biāo)顯著:抗原捕獲效率提升 2-3 倍,非特異性干擾降低 80%,共沉淀效率提升 1.5-2 倍,這些優(yōu)勢使其成為高精度蛋白質(zhì)互作研究的工具。
(二)市場認(rèn)可度:成為科研領(lǐng)域主流 IP 試劑
截至 2024 年,Jackson ImmunoPrecipitation 抗體已覆蓋人、小鼠、大鼠、兔等 15 + 物種,提供針對信號通路蛋白(如 EGFR、p53、ERK)、轉(zhuǎn)錄因子(如 NF-κB、STAT3)、病毒蛋白(如 SARS-CoV-2 N 蛋白)等 800 + 靶點的產(chǎn)品,全球年銷量超 8 萬支,被《Nature》《Cell》《Science》子刊引用超 1500 次,其中單篇最高引用文獻(xiàn)影響因子達(dá) 69.5(《Cell》2023 年腫瘤信號通路研究)。在 2024 年全球蛋白質(zhì)組學(xué)試劑用戶調(diào)研中,該系列抗體在 “IP 效率"“質(zhì)譜兼容性"“重復(fù)性" 三個維度的滿意度均,91% 的科研人員表示 “Jackson IP 抗體顯著提升了蛋白質(zhì)互作分析的數(shù)據(jù)質(zhì)量,減少了雜蛋白干擾,節(jié)省了實驗時間"。
(三)行業(yè)推動作用:加速蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)展
Jackson ImmunoPrecipitation 抗體不僅提升了實驗效率與數(shù)據(jù)質(zhì)量,還推動了蛋白質(zhì)互作研究技術(shù)的創(chuàng)新:通過高靈敏度捕獲低豐度、瞬時互作信號,助力發(fā)現(xiàn)新型蛋白質(zhì)互作關(guān)系(如 EGFR L858R 與 HSPA1A 的互作);通過高純度 IP 產(chǎn)物減少質(zhì)譜鑒定干擾,降低低豐度互作蛋白的鑒定難度;通過配套專用緩沖液與預(yù)偶聯(lián)磁珠,標(biāo)準(zhǔn)化 IP 實驗流程,推動多中心研究的數(shù)據(jù)一致性(如全球  病毒蛋白互作研究網(wǎng)絡(luò)采用該系列抗體)。此外,Jackson 還提供 “定制化 IP 抗體制備服務(wù)",支持科研人員針對新型靶點(如未注釋的孤兒蛋白)開發(fā)特異性 IP 抗體,進(jìn)一步拓展蛋白質(zhì)互作研究的范圍。
五、未來技術(shù)發(fā)展與展望
隨著蛋白質(zhì)組學(xué)研究向 “單細(xì)胞水平、動態(tài)互作、空間特異性" 方向發(fā)展,Jackson 計劃從以下三個方面推進(jìn) IP 抗體技術(shù)創(chuàng)新:
  1. 單細(xì)胞 IP 抗體技術(shù):研發(fā)適用于單細(xì)胞樣本的高靈敏度 IP 抗體,結(jié)合微流控技術(shù),實現(xiàn)對單個細(xì)胞內(nèi)低豐度蛋白質(zhì)復(fù)合物的捕獲與分析,助力解析細(xì)胞異質(zhì)性中的蛋白質(zhì)互作差異(如腫瘤干細(xì)胞與普通腫瘤細(xì)胞的信號通路互作差異)。

  1. 動態(tài)互作捕獲技術(shù):開發(fā) “光控 IP 抗體",通過光響應(yīng)性 linker 將抗體與磁珠偶聯(lián),可在特定時間點通過光照觸發(fā)抗體與磁珠解離,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)互作動態(tài)變化的實時捕獲(如信號通路激活后 0-60 分鐘內(nèi)的互作變化),解析互作的時間依賴性。

  1. 空間特異性 IP 技術(shù):結(jié)合 proximity labeling 技術(shù)(如 BioID、APEX),開發(fā)可在細(xì)胞特定亞結(jié)構(gòu)(如細(xì)胞核、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng))內(nèi)特異性捕獲蛋白質(zhì)互作的抗體,揭示不同細(xì)胞空間中蛋白質(zhì)互作的特異性差異(如細(xì)胞質(zhì)與細(xì)胞核中 p53 的互作網(wǎng)絡(luò)差異)。

關(guān)鍵詞
Jackson IP 抗體;蛋白質(zhì)互作;免疫沉淀;抗原親和成熟;質(zhì)譜鑒定



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