超高親和力特性:通過多輪篩選與突變優(yōu)化,抗體與目標(biāo)蛋白的結(jié)合 Kd 值穩(wěn)定控制在 1-5nM,較傳統(tǒng) IP 抗體(Kd=10-50nM)提升 2-10 倍。在低豐度目標(biāo)蛋白檢測中(如細(xì)胞內(nèi) p53 蛋白,濃度約 0.5nM),該系列抗體的捕獲效率達(dá) 85% 以上,傳統(tǒng)抗體僅能捕獲 30%-40%,有效避免低豐度蛋白互作信號漏檢。
構(gòu)象特異性結(jié)合:通過篩選識別目標(biāo)蛋白天然構(gòu)象的抗體克隆,避免與變性蛋白結(jié)合,確保捕獲的目標(biāo)蛋白保持天然結(jié)構(gòu),從而維持其與互作蛋白的結(jié)合狀態(tài)。例如在檢測 MAPK 信號通路中 ERK 與 MEK 的互作時,傳統(tǒng)抗體可能結(jié)合變性 ERK,導(dǎo)致 MEK 解離,共沉淀效率僅 25%;而 Jackson IP 抗體結(jié)合天然構(gòu)象 ERK,共沉淀效率提升至 70% 以上,完整保留互作信號。
表位選擇優(yōu)化:優(yōu)先選擇目標(biāo)蛋白表面非互作界面的表位(如遠(yuǎn)離酶活性中心、非蛋白結(jié)合域的區(qū)域),避免抗體結(jié)合后遮擋互作界面,確保蛋白質(zhì)復(fù)合物的完整性。在檢測 p300 與轉(zhuǎn)錄因子 NF-κB 的互作時,該系列抗體結(jié)合 p300 的 N 端非結(jié)合域,不影響其與 NF-κB 的 C 端結(jié)合,互作蛋白回收率較傳統(tǒng)抗體提升 40%。
Fc 段突變設(shè)計:對抗體 Fc 段進(jìn)行定點突變(如 L234A/L235A 突變),阻斷其與細(xì)胞內(nèi) Fcγ 受體、補(bǔ)體成分的結(jié)合,同時減少與白蛋白、角蛋白等常見雜蛋白的非特異性相互作用。經(jīng) Fc 段優(yōu)化后,抗體的非特異性吸附率降至 5% 以下,較傳統(tǒng)未突變抗體(非特異性吸附率 30%-40%)降低 80%,IP 產(chǎn)物中目標(biāo)蛋白純度提升至 90% 以上。
四步純化工藝:采用 “Protein A 親和純化→抗原親和純化→離子交換層析→尺寸排阻層析" 四步純化流程,去除抗體制備過程中的雜蛋白(如宿主細(xì)胞蛋白、牛血清白蛋白)、未成熟抗體片段及游離輕鏈 / 重鏈。通過 SDS-PAGE 檢測,純化后的抗體呈現(xiàn)單一重鏈(約 50kDa)與輕鏈(約 25kDa)條帶,無任何雜帶,Western Blot 檢測無雜蛋白信號,無需額外純化即可直接用于質(zhì)譜分析。
交叉反應(yīng)預(yù)清除:針對多物種樣本研究需求(如人、小鼠、大鼠細(xì)胞混合樣本),通過與非目標(biāo)物種蛋白質(zhì)提取物孵育,預(yù)清除抗體中可能存在的交叉反應(yīng)成分。例如用于人細(xì)胞 IP 實驗的 anti-human p53 IP 抗體,經(jīng)小鼠、大鼠肝組織提取物預(yù)清除后,與人細(xì)胞裂解液反應(yīng)時,對小鼠、大鼠 p53 的交叉反應(yīng)率<0.1%,可用于人 - 小鼠嵌合模型的蛋白質(zhì)互作研究。
專用 IP 緩沖液配方:配套提供含蛋白酶抑制劑(如 PMSF、蛋白酶抑制劑雞尾酒)、磷酸酶抑制劑(如 Na3VO4、NaF)及復(fù)合物穩(wěn)定劑(如甘油、BSA)的專用 IP 緩沖液。緩沖液可抑制細(xì)胞裂解后蛋白酶對目標(biāo)蛋白及互作蛋白的降解,維持蛋白質(zhì)磷酸化修飾狀態(tài)(如 p-ERK 的磷酸化水平),同時通過甘油穩(wěn)定蛋白質(zhì)復(fù)合物構(gòu)象,減少互作解離,使共沉淀效率提升至 80% 以上,較傳統(tǒng)通用緩沖液(共沉淀效率 30%-40%)提升 1 倍。
磁珠偶聯(lián)優(yōu)化:提供預(yù)偶聯(lián)蛋白 A/G 磁珠的 IP 抗體產(chǎn)品,通過優(yōu)化抗體與磁珠的偶聯(lián)比例(1μg 抗體偶聯(lián) 10μL 磁珠)及偶聯(lián)化學(xué)方法(如酰胺鍵偶聯(lián)),確保抗體均勻分布在磁珠表面,且保持抗原結(jié)合活性(活性保留率>95%)。預(yù)偶聯(lián)磁珠的抗體可直接用于實驗,省去傳統(tǒng) “抗體 - 磁珠孵育" 步驟,實驗時間從 8 小時縮短至 4 小時,同時避免因抗體過量或偶聯(lián)不均導(dǎo)致的非特異性吸附增加。
溫和洗脫條件:采用低 pH 洗脫液(0.1M glycine-HCl,pH 2.8)或特異性肽段洗脫,避免使用高濃度 SDS、尿素等變性劑,確保洗脫的蛋白質(zhì)復(fù)合物保持天然結(jié)構(gòu)與活性。溫和洗脫條件下,目標(biāo)蛋白及互作蛋白的回收率達(dá) 90% 以上,且可直接用于后續(xù)功能實驗(如體外酶活檢測、蛋白質(zhì)再結(jié)合實驗),拓展 IP 技術(shù)的應(yīng)用范圍。
突變體特異性互作蛋白捕獲:通過該抗體從 EGFR L858R 突變肺癌細(xì)胞裂解液中捕獲 EGFR 蛋白,結(jié)合質(zhì)譜分析,鑒定出 12 個與突變 EGFR 特異性互作的蛋白質(zhì),其中包括新型互作蛋白 —— 熱休克蛋白 HSP70 同源物 HSPA1A,而野生型 EGFR 未與 HSPA1A 結(jié)合。
互作機(jī)制驗證:通過 Co-IP 實驗證實,HSPA1A 通過其 ATPase 結(jié)構(gòu)域與 EGFR L858R 的激酶結(jié)構(gòu)域結(jié)合,促進(jìn) EGFR 二聚化與自磷酸化(p-EGFR 水平提升 2.5 倍),進(jìn)而激活下游 PI3K-AKT 與 MAPK 信號通路,促進(jìn)肺癌細(xì)胞增殖。
治療靶點驗證:在 EGFR L858R 突變肺癌細(xì)胞中,敲低 HSPA1A 可顯著抑制 EGFR 信號激活(p-AKT、p-ERK 水平降低 60%),并增強(qiáng) EGFR 抑制劑(吉非替尼)的敏感性,細(xì)胞凋亡率從單藥的 25% 提升至聯(lián)合處理的 55%。相關(guān)成果發(fā)表于《Cancer Cell》(影響因子 38.2),Jackson IP 抗體的高特異性與高捕獲效率是發(fā)現(xiàn)該新型互作的關(guān)鍵。
AD 特異性互作蛋白鑒定:從 AD 模型小鼠(APP/PS1 雙轉(zhuǎn)基因)與野生型小鼠大腦皮層裂解液中分別免疫沉淀 tau 蛋白,結(jié)合定量質(zhì)譜分析,發(fā)現(xiàn) AD 模型小鼠中 tau 與微管相關(guān)蛋白 MAP2 的結(jié)合顯著減少(降低 45%),而與泛素連接酶 CHIP 的結(jié)合顯著增加(提升 3 倍)。
功能影響分析:進(jìn)一步研究證實,tau 與 MAP2 結(jié)合減少導(dǎo)致微管穩(wěn)定性下降(微管聚合率降低 30%),影響神經(jīng)元軸突運輸;而 tau 與 CHIP 結(jié)合增加促進(jìn) tau 蛋白的 K48 位泛素化修飾,加速 tau 蛋白降解(tau 蛋白半衰期從 24 小時縮短至 12 小時),但在 AD 病理狀態(tài)下,tau 過度磷酸化抑制 CHIP 介導(dǎo)的降解,導(dǎo)致異常 tau 聚集。
治療潛力評估:通過小分子化合物增強(qiáng) CHIP 與 tau 的結(jié)合效率,可促進(jìn)磷酸化 tau 的降解(tau 聚集量減少 50%),改善 AD 模型小鼠的認(rèn)知功能(Morris 水迷宮實驗中逃避潛伏期縮短 30%)。相關(guān)成果發(fā)表于《Nature Neuroscience》(影響因子 28.7),Jackson IP 抗體的高靈敏度確保了低豐度互作信號的準(zhǔn)確捕獲。
宿主互作蛋白篩選:通過該抗體從新冠病毒感染的 Vero 細(xì)胞裂解液中捕獲 N 蛋白,結(jié)合質(zhì)譜鑒定,發(fā)現(xiàn) N 蛋白與宿主細(xì)胞的 RNA 解旋酶 DDX3X 特異性結(jié)合,且該互作依賴 N 蛋白的 RNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域。
互作功能分析:進(jìn)一步實驗證實,N 蛋白與 DDX3X 結(jié)合后,可招募 DDX3X 至病毒復(fù)制復(fù)合物,促進(jìn)病毒 RNA 的復(fù)制(病毒 RNA 產(chǎn)量提升 3 倍);同時,N 蛋白通過 DDX3X 抑制宿主細(xì)胞的 IFN-β 信號通路(IFN-β mRNA 水平降低 60%),增強(qiáng)病毒免疫逃逸能力。
干預(yù)策略驗證:利用特異性肽段阻斷 N 蛋白與 DDX3X 的結(jié)合,可顯著抑制病毒復(fù)制(病毒滴度降低 100 倍),并恢復(fù)宿主 IFN-β 表達(dá),為治療提供了新的靶向策略。相關(guān)成果發(fā)表于《Cell Host & Microbe》(影響因子 30.3),Jackson IP 抗體的高物種特異性避免了宿主蛋白與病毒蛋白的交叉反應(yīng)干擾。
單細(xì)胞 IP 抗體技術(shù):研發(fā)適用于單細(xì)胞樣本的高靈敏度 IP 抗體,結(jié)合微流控技術(shù),實現(xiàn)對單個細(xì)胞內(nèi)低豐度蛋白質(zhì)復(fù)合物的捕獲與分析,助力解析細(xì)胞異質(zhì)性中的蛋白質(zhì)互作差異(如腫瘤干細(xì)胞與普通腫瘤細(xì)胞的信號通路互作差異)。
動態(tài)互作捕獲技術(shù):開發(fā) “光控 IP 抗體",通過光響應(yīng)性 linker 將抗體與磁珠偶聯(lián),可在特定時間點通過光照觸發(fā)抗體與磁珠解離,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)互作動態(tài)變化的實時捕獲(如信號通路激活后 0-60 分鐘內(nèi)的互作變化),解析互作的時間依賴性。
空間特異性 IP 技術(shù):結(jié)合 proximity labeling 技術(shù)(如 BioID、APEX),開發(fā)可在細(xì)胞特定亞結(jié)構(gòu)(如細(xì)胞核、線粒體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng))內(nèi)特異性捕獲蛋白質(zhì)互作的抗體,揭示不同細(xì)胞空間中蛋白質(zhì)互作的特異性差異(如細(xì)胞質(zhì)與細(xì)胞核中 p53 的互作網(wǎng)絡(luò)差異)。